新的一周,Aitomistic带来一系列扎实的更新,主要集中在新发布的开源MLatom 3.19.1中,包含两大计算功能增强、一篇新鲜出炉的研究论文,以及给Premium用户的专属福利预告。
期待已久的功能来了!从MLatom 3.19.1开始,你可以直接使用新实现的锥形交叉点优化功能,计算势能面圆锥交叉点结构。
这项由Mikolaj实现的功能,采用了经典的惩罚-约束方法,其核心思路很巧妙:通过优化分子结构来最小化两个电子态的平均能量,同时通过惩罚函数缩小他们的能隙,避免了非绝热耦合的计算。这在无法直接获得非绝热耦合的研究场景中非常实用。该方法已在我们的前期研究中得到充分验证。我们准备了详细教程。

您可以在Aitomistic Hub上直接运行,案例包括用预训练MS-ANI模型优化富烯,以及用半经验ODM2方法优化环己二烯。现在,优化锥形交叉点只需一行简单的代码:
ml.ci_opt(molecule=fulvene, model=mlmodel)
分子动力学模拟引擎迎来重要更新,新增对Langevin恒温器的支持。您可以通过简单的参数设置即可在模拟中使用该恒温器,使模拟条件更贴近真实物理环境。
Langevin = ml.md.Langevin_thermostat(temperature=300,molecule=init_mol,tau=0.001)
上周二,《J Chem. Theory Comput.》杂志发表了一项基于MLatom进行主动学习的合作研究 !该工作开发了名为MELTS的程序,成功将Newton-X与MLatom对接,实现了全自动的主动学习流程,用以加速机器学习驱动的最少面跳跃动力学模拟。这对Newton-X用户群体来说是个好消息!

论文信息:Matheus de Oliveira Bispo et al. "MELTS: Fully Automated Active Learning for Fewest-Switches Surface Hopping Dynamics." *J. Chem. Theory Comput. *2025.
想深入了解主动学习? 我们整理了相关视频和论文资源,涵盖非绝热动力学和基态模拟,欢迎在B站上查看。
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