过渡态搜索，如今只需"聊一句"（Protomia 2.6.0）
引子
在计算化学里，过渡态（transition state, TS）决定了反应能否发生、有多快——但它也出了名地难找：往往要反复调试输入文件、凭经验猜测初始结构，再一轮轮排查虚频。
最新版 Protomia（2.6.0） 新增了可用自然语言驱动的过渡态搜索：你用一句话描述反应，AI 智能体便会依次完成反应路径搜索（NEB）、过渡态优化、虚频确认、IRC 验证与反应能量图绘制，并将结果反馈给你。下面是一个完整的示例。
一句话，全流程
我们以经典的氨分子（NH₃）伞形翻转为例。用户只输入了一句话：
「请帮我找到氨分子伞形翻转反应的过渡态，确认虚频，并做 IRC、画出反应能量图。」
随后，智能体自动完成了下面几步。
第一步：NEB 构建反应路径，锁定过渡态 用**力松弛的 CI-NEB（微动弹性带）**在反应物与产物之间构建反应路径，能量最高点即为过渡态初猜，并自动绘制反应能量曲线。
第二步：虚频确认——这是真正的过渡态吗？ 对过渡态做频率分析，结果恰好只有一个虚频（−871.1 cm⁻¹），且其振动模式正是"伞形翻转"（氢原子穿过氮原子所在平面）。判定：VALID TS ✓。
第三步：IRC 验证反应路径 沿**内禀反应坐标（IRC）**正反两个方向追踪，确认该过渡态确实平滑连接了两个等价的锥形极小（反应物 ↔ 产物），并绘制沿途能量曲线。
结果一览
| 项目 | 数值 |
|---|---|
| 过渡态能量 | −56.4985 Hartree |
| 虚频 | −871.1 cm⁻¹ |
| 正向能垒 | 6.1 kcal/mol |
| 对称性 | 平面 D₃h（偶极 = 0） |
| IRC 连接性 | 反应物 ↔ TS ↔ 产物 ✓ |
算出的能垒 6.1 kcal/mol 与实验值（约 5.8 kcal/mol）相当接近。
这个示例里值得一提的点
- 对话驱动、全自动：一句自然语言即完成上述全部步骤；智能体在后台自动提交任务、等待并分析结果。
- AIQM3 模型：本示例由我们的 AIQM3 模型完成，算出的能垒也与实验值相符。
- 在线即用：无需本地安装，注册后在浏览器中即可运行。
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你可以直接用一句话描述你的反应（给出反应物与产物，或初猜结构），例如：
帮我找到这个反应的过渡态：
反应物：NH3（金字塔构型）
产物：NH3（翻转后的金字塔构型）
请做 NEB → 频率确认 → IRC，并画出反应能量图。
（如需，可附上 XYZ 结构文件，AI 会自动完成其余步骤。）
文末附：About-me（中文）+ QQ 交流群 —— 见 boilerplate。
#计算化学 #机器学习 #人工智能 #过渡态 #AI智能体
Format → 公众号文章：嵌入横版视频（ts_landscape_smooth.mp4）+ 关键图（NEB/IRC 能量曲线、汇总表）。视频号：改用竖版视频（ts_portrait_smooth.mp4）。